Wojewódzka Stacja Sanitarno-Epidemiologiczna w Gdańsku jest jednostką budżetową będącą podmiotem leczniczym finansowanym z budżetu państwa.

Wojewódzka Stacja Sanitarno-Epidemiologiczna w Gdańsku jest dysponentem środków budżetowych trzeciego stopnia w zakresie wykonywania budżetu państwa.

W ustawie budżetowej na rok 2024 dochody i wydatki budżetu ustalone zostały następująco:

1. Dochody:                                                 1 497 000 zł                               

2. Wydatki:                                                49 943 000 zł                                

z tego:
a) wydatki bieżące:                                     49 878 000 zł       

b) świadczenia na rzecz osób fizycznych:              65 000 zł